Sağlık alanında kök hücreler; hasar görmüş dokuların onarımı, organ yetmezliği, bağışıklık sistemi bozuklukları ve bazı nörolojik hastalıkların tedavisi gibi birçok alanda araştırılmakta ve klinik çalışmalarda kullanılmaktadır. Özellikle kan hastalıklarında, kök hücre nakilleri uzun yıllardır başarıyla uygulanmaktadır.

Ayrıca estetik ve rejeneratif tıpta da kök hücreler cilt yenileme, doku gençleştirme ve saç dökülmesi gibi problemlerde kullanılmaktadır. Bu işlemlerde genellikle bireyin kendi dokusundan elde edilen kök hücreler tercih edilmekte, böylece doku uyumu problemi yaşanma riski en aza indirilmektedir.

Tüm bu uygulamaların bilimsel temelleri güçlü araştırmalara dayanmaktadır ve her geçen gün yeni kullanım alanları keşfedilmektedir. Ancak her tedavi yöntemi gibi, kök hücre uygulamaları da uygun hasta seçimi, doğru endikasyon ve etik standartlar çerçevesinde gerçekleştirilmelidir.